ImageJ – en software til at analysere og behandle billedfiler. Softwaren er i stand til effektivt at analysere billedet og modtage de detaljerede tekniske data. ImageJ understøtter de fleste af de billedformater og har et sæt redigeringsværktøjer. Softwaren gør det muligt at producere de forskellige geometriske transformationer, oprette histogrammer densitet, foretage 3D-visualisering, udføre de logiske og aritmetiske operationer mellem billeder osv ImageJ er i stand til samtidigt at arbejde med flere billeder, anvende forskellige filtre og udfører batch behandling af filer. ImageJ indeholder mange plagins der i høj grad udvider mulighederne i softwaren.