Total Commander Ultima Prime – et sæt forskellige software og yderligere indstillinger for at udvide funktionaliteten i Total Commander-filhåndtering. Softwaren hjælper med at organisere filer og mapper, udføre søgningen efter nødvendige data, overføre dem og udføre mange andre opgaver relateret til filhåndtering. Total Commander Ultima Prime indeholder KeePass til at administrere adgangskoderne, TeamViewer for fjernadgang, Gimp og XnView til at arbejde med billederne, AIMP for at afspille lyden osv. Softwaren understøtter batchfilbehandling, fungerer sammen med de forskellige arkivformater og burns cd’erne. Total Commander Ultima Prime gør det også muligt at tilpasse farveskemaet, menuerne, skrifttyperne, vinduesvisningen og andre aspekter af grænsefladen til individuelle brugerbehov.